ICTS – Innovation Center for Tropical Science

Identifikasi Sumber Zoonosis Virus COVID-19

Investigasi hewan dan lingkungan: Identifikasi sumber zoonosisVirus COVID-19

1.  TINJAUAN BERDASARKAN PENGETAHUAN SAAT INI

Banyak pertanyaan penting yang masih belum terjawab tentang asal hewan dari virus COVID-19.  Meskipun sumber hewan kemungkinan, kelangkaan informasi meninggalkan kesenjangan pengetahuan yang signifikan, yang membuat pintu terbuka untuk spekulasi dan rumor.  Kurangnya bukti juga menyebabkan, dan beberapa cara mengharuskan, beberapa asumsi dibuat.

Dari apa yang diketahui, virus COVID-19 yang diisolasi dari manusia berbagi 96% homologi dengan betacoronavirus diisolasi dari beberapa spesies kelelawar dalam genus Rhinolophus (Yunnan, 2013) . SARS-CoV yang diisolasi dari manusia berbagi 92% homologi dengan virus mirip SARS yang beredar pada kelelawar.  90% virus mirip SARS dari kelelawar telah diisolasi dari genus Rhinolophus. Itu homologi urutan genetik yang relatif kuat antara virus COVID-19 dan beta coronavirus diisolasi dari kelelawar menunjukkan bahwa nenek moyang virus COVID-19 beredar pada kelelawar, Genus Rhinolophus. Kelelawar yang termasuk dalam genus Rhinolophus tersebar luas di seluruh Asia Timur Tengah, Afrika dan Eropa.

Ada bukti bahwa penularan SARS-CoV dari reservoir hewan ke manusia melibatkan hewan inang perantara (musang dilibatkan sebagai perantara perantara untuk SARS-CoV).  Karena kesamaan antara SARS-CoV dan virus COVID-19, termasuk keadaan di sekitar kemunculannya, dan mempertimbangkan tidak adanya teori yang masuk akal lainnya, asumsi alternatif sedang dibuat bahwa rute penularan virus COVID-19 ke manusia melibatkan inang hewan perantara yang belum diidentifikasi VS dari kelelawar menular langsung ke manusia. Epidemiologi MERS menunjukkan bagaimana peran inang perantara dapat lebih signifikan pada antarmuka hewan manusia daripada sumber hewan asli asal virus.  Dengan demikian, penting untuk menyelidiki keterlibatan inang perantara dan untuk mengidentifikasi. 

Data epidemiologis manusia menghubungkan proporsi kasus manusia generasi pertama dan kedua yang tinggi COVID-19 ke Pasar Grosir Makanan Laut Huanan di Wuhan.  Sebuah asumsi dibuat bahwa Virus COVID-19 diperkenalkan kepada manusia yang mengunjungi atau bekerja di pasar.  Dengan tidak adanya data epidemiologis yang terperinci, beberapa hipotesis ada untuk pengenalan virus COVID-19 hewan ke manusia di pasar.  Ini termasuk (1) virus diperkenalkan ke manusia populasi dari sumber hewan di pasar dan (2) bahwa manusia memperkenalkan virus COVID-19 pasar (mengikuti paparan virus di luar pasar) dan virus itu kemudian diperkuat hewan yang kemudian menginfeksi manusia.

Hanya ada informasi awal dan tidak lengkap dari investigasi ke sumber hewan di pasar.  Hal ini dapat dimengerti mengingat pentingnya dan urgensi memfokuskan pada respons penyakit kesehatan masyarakat.  Namun, informasi dari investigasi ini sangat penting karena mungkin memegang kunci untuk mencegah masuknya virus lebih lanjut ke populasi manusia, dan itu juga dapat memberikan wawasan yang bermanfaat untuk mengurangi risiko limpahan (Spill over) di masa depan dari kejadian kasus penularan dari hewan ke manusia.

Dengan tidak adanya informasi terperinci, asumsi berikut dibuat.  Ini merupakan limpahan penularan dari hewan ke manusia terjadi di Pasar Grosir Makanan Laut Huanan.  Fakta bahwa satwa liar itu dijual di pasar makanan laut menunjukkan kemungkinan rute introduksi oleh spesies liar yang dibawa ke pasar.  Kemungkinan banyak spesies hewan yang berbeda ada di pasar.  Contoh investigasi kemungkinan akan terjadi beberapa hari (setidaknya satu periode inkubasi) setelah hewan paparan manusia telah terjadi, pada saat mana hewan sumber mungkin tidak lagi berada di pasar.
Diketahui bahwa sampel diambil dari beberapa spesies hewan dan tidak ada satupun sampel diuji hasilnya positif, namun informasi tentang jumlah sampel dan spesies sampel adalah tidak tersedia.  Namun, beberapa sampel lingkungan (swab) dilakukan tes hasilnya positif dan virus diisolasi dari sampel lingkungan.  

Tidak jelas bagaimana tepatnya hewan-hewan itu dituduh positif sampel lingkungan (selain mengetahui bahwa sampel diambil dari daerah yang berbatasan dengan tempat binatang telah dipelihara).  Fakta bahwa virus COVID-19 mudah diisolasi dari lingkungan spesimen yang diambil di Pasar Grosir Makanan Laut Huanan menunjukkan bahwa ketahanan virus lingkungannya baik dan / atau viral load di lingkungan itu tinggi.  Secara umum, COVID-19 virus dan virus seperti SARS lainnya tampaknya stabil; ini memiliki implikasi untuk kontaminasi dan ketahanan di lingkungan dan pada fomites.

Informasi yang tersedia juga menunjukkan bahwa relatif mudah untuk membiakkan dan mengisolasi virus COVID-19 dari spesimen dan bahwa virus tumbuh dengan baik di Vero sel.
Sangat penting bahwa informasi epidemiologis dan virologi penting yang dapat menjelaskan munculnya dan penularan virus COVID-19 dari hewan ke manusia dikumpulkan dan disimpan.  Kesempatan untuk memahami kejadian ini tidak boleh terlewatkan.


Rekomendasi umum secara langsung:·        

  • Kelompok Penasihat menyarankan agar dilakukan kolaborasi teknis untuk mendukung penyelidikan terhadap sumber penyakit pada hewan.·        
  • Kerjasama multisektoral satu kesehatan harus didorong termasuk pakar kesehatan hewan, kesehatan masyarakat, satwa liar.·        
  • Berbagi informasi langsung dari investigasi lapangan sejauh ini (termasuk hasil positif maupun hasil negative) harus didorong.


2.  PRIORITAS PENELITIAN (KATEGORI LUAS)

PENILAIAN SURVEILAN DAN RISIKO

Tujuan strategis: Untuk mengembangkan pemahaman yang lebih baik tentang penentu utama virus COVID-19 infeksi dan dinamika penularan pada hewan (termasuk pada tingkat ekosistem) dan kepada manusia untuk diinformasikan penelitian, pengawasan, dan pengendalian.

Identifikasi reservoir hewan dan inang perantara melalui pengawasan / investigasi strategi yang mempertimbangkan:

  • Bukti bahwa nenek moyang virus COVID-19 bersirkulasi pada kelelawar dari genus Rhinolophus.
  • Tidak adanya informasi tentang inang perantara, yang dapat berupa sejumlah spesies hewan (termasuk satwa liar, hama, hewan peliharaan (pendamping atau ternak), hewan liar / liar).
  • Dengan tidak adanya informasi spesifik, studi tentang peran hewan mungkin perlu dipertimbangkan berbagai jenis dan spesies hewan.  Jika memungkinkan dan sesuai, informasi ilmiah (epidemiologis, virologis, genetik, dll.) dapat memandu dan mendukung penargetan investigasi.
  • Pengawasan serologis yang luas lebih mungkin mendeteksi virus COVID-19 pada hewan daripada pengawasan virologi saja (pengawasan virologi terlalu sempit).  Studi serologis bisa memandu pengawasan virologi dengan target yang lebih spesifik.
  • Penargetan pengawasan ke lokasi tertentu dapat meningkatkan kemungkinan deteksi misalnya pasar / peternakan tempat satwa liar dan spesies hewan lainnya (termasuk domestic binatang / ternak dikumpulkan (khususnya pasar dengan tautan ke Seafood Huanan) Pasar grosir).  Lokasi pengambilan sampel dapat mencakup titik-titik lain yang diidentifikasi sepanjang pasokan rantai ke dan dari pasar.  Investigasi di sekitar pasar juga harus mempertimbangkan bahwa, banyak pasar telah ditutup untuk mendukung upaya pengendalian.
  • Jenis hewan lain (jarak bebas, liar, hama) ditemukan di dekat pasar (dan lainnyalokasi yang relevan) juga harus dipertimbangkan dalam penyelidikan.
  • Strategi dapat mencakup pengujian sampel hewan yang diarsipkan (serum, tinja, dll.) yang dikumpulkan dari proyek surveilans terbaru.
  • Sampel lingkungan yang positif dapat diuji untuk bahan genetik spesies hewan (menggunakan metagenomics atau teknik pengkodean bagian DNA (pengkodean bagian DNA mungkin lebih efisien daripada mengurutkan seluruh genom)).  Pendekatan ini dapat memandu penyelidikan mengidentifikasi sumber pencemaran lingkungan.
  • Kelompok Rhinolophus memiliki jangkauan luas, penelitian terpadu di China telah menemukan >50 SARS-seperti CoV.  Menggunakan set data keanekaragaman hayati dan keanekaragaman hayati-filogenetik untuk memodelkan penargetan pengambilan sampel untuk meningkatkan kemungkinan mengidentifikasi berbagai reservoir di Asia, Timur-Tengah dan Eropa.


Jalur Transmisi / Penularan

  • Selidiki jalur transmisi potensial dari reservoir hewan ke inang perantara untuk manusia.
  • Evaluasi peran host perantara dalam memperkuat virus.
  • Selidiki rute dan durasi pelepasan virus dari host potensial.
  • Selidiki persistensi virus dengan berbagai kondisi lingkungan. Pengujian satwa liar yang dibudidayakan, pasar satwa liar dan hewan liar dari spesies selain kelelawar itu dapat menjadi inang perantara untuk mengidentifikasi potensi CoV dan jalur transmisi yang memungkinkan untuk manusia.
  • Selidiki kemungkinan penularan dari manusia ke hewan (hewan peliharaan).


Jenis Inang

  • Selidiki kemungkinan jenis inang hewan yang mungkin dari virus COVID-19 (termasuk penggunaan uji lapangan) (serologi) dan studi laboratorium).

Dinamika perdagangan satwa liar

  • Lebih memahami dinamika perdagangan satwa liar, misalnya asal usul berbagai spesies satwa liar di pasar, keanekaragaman spesies, praktik peternakan / produksi, kontak / pencampuran kelompok, rantai pasokan dll.


Kemungkinan peran ternak

  • Serta menilai kemungkinan peran jenis hewan lain (satwa liar, hewan liar), akan penting dilakukan untuk mempertimbangkan kemungkinan peran ternak, termasuk kemungkinan bagi ternak terinfeksi dari manusia.

Rekomendasi Umum secara Langsung

  • Kelompok Penasihat menawarkan kolaborasi teknis untuk mendukung penyelidikan terhadap hewan tersebut sumber.
  • Harus didorong kerjasama multisektoral One Health termasuk pakar kesehatan hewan, kesehatan masyarakat, satwa liar.
  • Harus didorong berbagi informasi langsung dari investigasi lapangan sejauh ini (termasuk positif dan hasil negatif).

Kemungkinan peran hewan peliharaan dalam epidemiologi penyakit manusia

  • Menilai peran potensial hewan peliharaan dan hewan kesayangan dalam epidemiologi penyakit di negara-negara yang terkena kasus manusia.  Pertimbangkan investigasi / pengambilan sampel hewan peliharaan manusia yang dicurigai atau dikonfirmasi tertular penyakit.

DIAGNOSTIK

Tujuan strategis: Untuk mengembangkan alat diagnostik (untuk digunakan dalam spesies hewan) yang memberikan konsistensi hasil optimal dalam pengujiannya.

Serologi

  • Tes serologi yang sesuai untuk tujuan untuk digunakan pada spesies yang berbeda akan menjadi alat surveilans yang baik untuk virus COVID-19 pada hewan (kegunaan dari serologi ditunjukkan dalam Investigasi virus SARS-CoV dan Hendra).
  • Adaptasi dan validasikan uji serologi saat ini untuk antibodi terhadap virus COVID-19 yang digunakan di manusia ke sistem pengujian pada hewan.
  • Pertimbangkan untuk mengembangkan peralatan serologi laboratorium dan lapangan untuk investigasi hewan.
  • Menilai reaktivitas silang antara virus COVID-19 dan virus lain yang mirip SARS.§Tehnik protein rekombinan dapat berperan dalam mengembangkan teknik serologis.

RT-PCR

  • Platform RT-PCR untuk virus COVID19 telah dikembangkan dan disebarluaskan untuk digunakan uji untuk manusia.
  • Platform RT-PCR untuk virus COVID-19 perlu disesuaikan dengan sistem pengujian pada hewan.
  • Alat pengujian RT-PCR perlu disesuaikan agar tepat tujuan misalnya untuk skrining awal sampel hewan pada survelilans, sensitivitas akan lebih daripada spesifitas, oleh karena itu untuk srining RT-PCR, digunakan primer yang menjangkau seluruh subkelompok virus seperti SARS bisa digunakan (dengan SARS sebagai kontrol positif).  RT-PCR yang lebih spesifik untuk virus COVID-19 dapat digunakan untuk membedakan virus ketika sampel positif pada skrining.

Tes lainnya

  • Netralisasi virus, partikel pseudo VN, dan tes lain mungkin juga berguna untuk deteksi sampel hewan.

PENCEGAHAN DAN INTERVENSI PENGENDALIAN

Tujuan strategis: Untuk memandu intervensi berbasis bukti yang ditargetkan dan efektif.

Saran: Selain prioritas yang tercantum di bawah Surveilans dan Analisa risiko di atas:

Kumpulkan data dasar untuk menginformasikan strategi pencegahan dan pengendalian

  • Melakukan studi untuk mengembangkan pemahaman yang lebih baik tentang dinamika di sekitar satwa liar illegal termasuk kegiatan yang berkaitan dengan penangkapan, pengangkutan, dan perdagangan satwa liar, dan strategi pencegahannya  saat ini, dengan mempertimbangkan:
    • Ilmu sosial seputar perilaku kriminal.
    • Studi sosial / pemasaran tentang permintaan konsumen.
    • Standar internasional yang ada, perjanjian, perundang-undangan, dan pedoman seputar perdagangan satwa liar, pasar, dll.
    • Stakeholder yang relevan – LSM, IO, pemerintah nasional, publik, penjahat, pedagang.
    • Koordinasi antara penegakan hukum, layanan veteriner, pasar inspektur / regulator.
    • Efektivitas berbagai intervensi misalnya penegakan hukum, perundang-undangan, penuntutan, komunikasi risiko, insentif praktik hukum, sertifikasi.
    • Penggunaan inovasi dan teknologi dalam pengawasan / penuntutan pidana – kamera, drone, identifikasi hewan.
    • Manajemen pasar basah di Cina, khususnya di Wuhan.
    • Identifikasi praktik dan perilaku berisiko tinggi (untuk tumpahan acara) di sepanjang makanan / satwa liar rantai pasokan.

Menilai praktik yang berisiko tinggi

  • Penggerak sosial dan ekonomi dari kegiatan legal dan ilegal.
  • Rantai nilai yang mengarah pada paparan terhadap hewan / satwa liar / manusia.

Pembangan strategi kurangi risiko spillover

  • Penelitian untuk menentukan strategi komunikasi risiko paling efektif yang dihindari stigmatisasi dan konsekuensi lain yang tidak diinginkan.
  • Penelitian untuk menentukan praktik perubahan sosial dan perilaku yang paling efektif meningkatkan praktik kebersihan di pasar basah.
  • Penelitian untuk menentukan praktik kebersihan dan higinis paling efektif untuk menerapkan yang realistis dan layak strategi untuk mendorong tingkat kepatuhan yang tinggi di pasar basahPenelitian untuk menentukan strategi untuk secara ketat mengelola peternakan hewan liar dan menghentikan transportasi dan perdagangan ilegal serta penyelundupan.

Informasi dari studi laboratorium

  • Dengan tidak adanya data lapangan, studi laboratorium hewan dapat membantu menginformasikan pencegahan dan strategi pengendalian misalnya model pada hewan.

INTERAKSI INANG-PATOGEN

Tujuan strategis: Untuk meningkatkan pemahaman tentang interaksi inang-virus dan faktor-faktor yang berdampak pada interaksi seperti patogenesis penyakit, penularan, dan respons imun untuk memberi informasi yang lebih baik untuk pengendalian infeksi.

Studi Patogen Host

  • Kerentanan hewan – penentuan kisaran inang, spesifisitas / distribusi reseptor di spesies yang berbeda dll.
  • Infeksi cell line dan infeksi hewan percobaan untuk memahami penularan dan patogenisitas.
  • Epidemiologi CoV di reservoir hewan, yaitu dari kelelawar ke spesies lain (viral load, rute transmisi).

Risiko perilaku

  • Identifikasi komunitas dengan tingkat paparan tinggi terhadap kelelawar dan satwa liar utama lainnya; menganalisa perilaku berisiko mereka; uji sampel dari satwa liar dan orang-orang di komunitas ini untuk bukti serologis virus COVID-19 dan spillover CoV lainnya.
  • Memasukkan pertanyaan kunci standar tentang paparan satwa liar untuk digunakan selama wawancara dengan kasus yang diduga.

SOSIAL-EKONOMI DAN KEBIJAKAN

Tujuan strategis: Untuk meningkatkan efektivitas deteksi, pencegahan dan tindakan pengendalian melalui integrasi analisis sosial, ekonomi dan kelembagaan dari lingkungan yang terkena dampak

Perdagangan satwa liar

  • Menentukan apa yang dimaksud dengan satwa liar (yaitu satwa liar yang dibudidayakan vs hewan / ternak dll.) Di konteks yang berbeda.
  • Mengkarakterisasi rantai nilai perdagangan satwa liar secara global dan regional dan bagaimana hubungannya.
  • Penelitian kebijakan / sosial untuk mengatur perdagangan satwa liar – inovasi (kamera, drone, dll.), kolaborasi dengan ilmuwan sosial, penegakan hukum / perilaku / pola demografis.
  • Studi dampak ekonomi dari menghilangkan satwa liar dari pasar dan penutupan pasar.▪ Analisis dampak sosial dan analisis ekonomi dari berbagai tingkat pembatasan perdagangan satwa liar untuk makanan: 1) larangan penuh; 2) larangan sebagian (spesies tertentu); 3) mengatur dan menguji hewan; 4) mempromosikan hanya satwa liar yang diternakkan sebagai sumber makanan.

Penangkapan satwa liar vs. produksi

  • Analisis skenario apakah berternak satwa liar mengurangi risiko munculnya CoV sebagai dibandingkan dengan satwa liar yang ditangkap.

Konsumsi satwa liar

  • Survei publik untuk menilai pengetahuan, sikap, dan praktik di sekitar satwa liarkonsumsi, variasi geografis, dan perubahan demografi.

Hewan peliharaan

  • Menarik penelitian / komunikasi risiko yang sudah ada di bidang ini yang berkaitan dengan penyakit zoonosis lainnya (mis. zoonosis influenza, Nipah, SARS, dll.) yang terkait dengan pemuliaan, memelihara, menjual dan mengkonsumsi ternak.

3.  CATATAN UMUM TAMBAHAN

Ada kebutuhan untuk belajar pelajaran dari pengenalan virus COVID-10 ke populasi manusia dan dari kejadian serupa di masa lalu. Kejadian serupa di masa depan tidak bisa dihindari.

Penelitian

Ada kebutuhan untuk menyoroti keterbatasan tujuan penelitian untuk mengelola hasil yang diharapkan.

Strategi mitigasi risiko

Penting untuk mengambil pendekatan jangka panjang yang komprehensif untuk strategi mitigasi risiko yang bertujuan mengurangi risiko kejadian spillover.Strategi mitigasi risiko perlu dilakukan dan mempertimbangkan kepentingan budaya dari praktik-praktik tertentu yang berisiko tinggi. Mereka perlu mengadopsi pendekatan multidisiplin (dokter hewan, ekonom, ahli kesehatan makanan, ahli mikrobiologi, social ilmuwan, pakar komunikasi) dan dapat menyertakan paket tindakan mitigasi risiko yang ditargetkan untuk pemangku kepentingan yang tepat.  Dalam komunikasi risiko ada kebutuhan untuk menjadi jelas tentang ketidakpastian saat ini di sekitar peran hewan dalam wabah manusia atau spesies hewan yang terlibat dan akan penting untuk mengelola harapan misalnya risiko bisa dikurangi tetapi tidak dihilangkan. Untuk jangka pendek, pesan utama adalah bahwa risiko tertinggi untuk infeksi virus COVID-19 adalah penularan dari manusia ke manusia; mengidentifikasi inang hewan hanya merupakan tindakan tambahan sehingga kejadian (jarang) lainnya spillover dapat dikurangi dan wabah serupa manusia dicegah di masa depan.  

Komunikasi risiko juga dapat dibangun dengan bahan di atas yang dikembangkan untuk strategi mitigasi risiko lainnya (Ebola dan satwa liar / hewan liar, flu burung zoonosis dan pasar burung hidup).  Spektrum orang yang berisiko dalam sistem yang berbeda (ilmuwan lapangan, petani, pedagang, konsumen) perlu dipertimbangkan dalam komunikasi risiko dan strategi mitigasi risiko lainnya. Intervensi perlu ditargetkan untuk dampak positif maksimal dan kebijakan harus dihindari atau mengelola konsekuensi negatif yang tidak diinginkan (penilaian dampak regulasi). Studi dan panduan tentang perdagangan dan konsumsi satwa liar harus disesuaikan dengan tingkat global dan tingkat regional yaitu cakupan global sambil mempertimbangkan karakteristik dan kekhususan regional.  Strategi harus realistis dan fokus pada pengurangan risiko daripada penghapusan dan harus mengambil pelajaran dari inisiatif kebijakan lain yang berhasil yang menyebabkan perubahan perilaku misalnya tentang pentingnya memakai sabuk pengaman, bahayanya merokok, dan pentingnya diet sehat.

Sumber:OIE International : Konferensi Zoom, pada hari Jumat 31 Januari 2020, 13:00 (waktu Paris)

Leave a Comment

Your email address will not be published. Required fields are marked *